Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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