Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LMAN2Q12907 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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