Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TTPAP49638 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TTPAP49638 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
TTPAP49638 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TTPAP49638 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTPAP49638 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TTPAP49638 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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