Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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HOXD10P28358 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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HOXD10P28358 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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HOXD10P28358 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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HOXD10P28358 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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HOXD10P28358 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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HOXD10P28358 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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