Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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HOXD8P13378 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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