Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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SH3BP4Q9P0V3 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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