Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms