Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280.7 ms