Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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