Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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