Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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