Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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FOXC1Q12948 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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FOXC1Q12948 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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FOXC1Q12948 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 LRRC2-AS1-201ENST00000599511 2291 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 WDR19-201ENST00000399820 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ABCB4-203ENST00000359206 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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FOXC1Q12948 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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