Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SORBS2-201ENST00000284776 5996 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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PKHD1P08F94 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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