Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms