Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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