Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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TCIRG1Q13488 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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TCIRG1Q13488 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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TCIRG1Q13488 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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TCIRG1Q13488 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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TCIRG1Q13488 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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