Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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