Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
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