Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms