Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMEM225BP0DP42 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms