Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms