Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 MIR6732-201ENST00000619365 60 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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LINC00587B1AMM8 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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LINC00587B1AMM8 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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LINC00587B1AMM8 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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LINC00587B1AMM8 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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LINC00587B1AMM8 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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LINC00587B1AMM8 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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LINC00587B1AMM8 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LINC00587B1AMM8 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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