Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AC007237.1-201ENST00000442074 499 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 RPL23AP10-201ENST00000489946 466 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AC073913.2-201ENST00000541512 145 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AC007375.2-201ENST00000557752 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 BTF3L4-202ENST00000472944 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 ZNF701-201ENST00000301093 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 NUCB2-208ENST00000529010 2274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 DDX3Y-202ENST00000360160 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 AL049833.3-201ENST00000623920 3738 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 GDNF-AS1-203ENST00000514532 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 ZBTB20-AS1-203ENST00000475939 1687 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 PIWIL3-202ENST00000527701 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 CFAP57-201ENST00000372492 4244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 TTC39A-212ENST00000447632 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
U3KPZ7 FLI1-202ENST00000344954 3427 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 PPP2R2B-211ENST00000508545 2042 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 IL37-205ENST00000353225 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 RPL7AP72-201ENST00000417266 768 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 RN7SL571P-201ENST00000468302 295 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 AC020908.2-201ENST00000595134 405 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 AL109806.1-201ENST00000623967 1248 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 snoMe28S-Am2634.2-201ENST00000637869 80 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 LINC00604-202ENST00000637924 684 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 SOCS6-203ENST00000582322 2625 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 MSH5-205ENST00000395853 2704 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 OVCH1-201ENST00000318184 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 MKL2-205ENST00000572567 2185 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 DCLRE1C-209ENST00000378278 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 AP4S1-204ENST00000542754 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 AL356289.3-201ENST00000640049 2669 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
U3KPZ7 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
U3KPZ7 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
U3KPZ7 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
U3KPZ7 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
U3KPZ7 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
U3KPZ7 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
U3KPZ7 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
U3KPZ7 TTC33-201ENST00000337702 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms