Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTNNA3Q9UI47 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms