Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCBE1Q6UXH8 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms