Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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