Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms