Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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