Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CDH18Q13634 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CDH18Q13634 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CDH18Q13634 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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CDH18Q13634 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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