Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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TCOF1Q13428 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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TCOF1Q13428 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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TCOF1Q13428 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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TCOF1Q13428 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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TCOF1Q13428 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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TCOF1Q13428 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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