Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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