Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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DUSP4Q13115 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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DUSP4Q13115 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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DUSP4Q13115 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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DUSP4Q13115 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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