Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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