Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms