Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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