Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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HOXD10P28358 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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HOXD10P28358 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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