Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms