Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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HOXA3O43365 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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HOXA3O43365 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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HOXA3O43365 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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HOXA3O43365 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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HOXA3O43365 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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HOXA3O43365 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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HOXA3O43365 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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HOXA3O43365 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXA3O43365 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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