Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MTSS1O43312 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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