Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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