Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms