Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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VGLL1Q99990 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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VGLL1Q99990 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VGLL1Q99990 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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