Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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