Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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