Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ATP2B2-203ENST00000383800 8900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 EPHA5-201ENST00000273854 8266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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HERC1Q15751 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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HERC1Q15751 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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