Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms