Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms