Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFTN1Q14699 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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