Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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COL4A6Q14031 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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COL4A6Q14031 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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COL4A6Q14031 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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