Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CUL4AQ13619 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CUL4AQ13619 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CUL4AQ13619 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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CUL4AQ13619 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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